Nel presbiterio, nell’ultima campata di ciascuna delle due navate laterali, si trova, in due corpi contrapposti, l’organo a canne. Nella campata della navata sinistra è sito l’organo grande, le cui canne di facciata sono state conservate dallo strumento precedente, mentre nella navata destra si trova una piccola parte di organo corale.

Lo strumento, costruito dalla ditta Tamburini nel 1963, con progetto e collaudo del Maestro Alessandro Esposito, aveva in origine il corpo del positivo in cassa espressiva. Negli anni ‘80 fu deciso di renderlo aperto, spostandolo nella collocazione attuale, e nell’occasione vennero aggiunti alcuni nuovi registri: la Tromba Squillo 8’ e il Tromboncino 8’ al Grand’Organo, il Fagotto, il Nazardo e il Principale 8’ al positivo.

L’ultima revisione nella struttura con ampliamento risale al 1991, con l’aggiunta della Tromba Armonica al recitativo e del particolare accessorio delle Campane. Con il rifacimento della trasmissione digitale, fu inoltre trasformata la Tromba Squillo in tromba ad alta pressione, nei tagli 16’, 8’ e 4’.

Lo strumento è interamente a trasmissione elettrica, dotato di 53 registri. La grande consolle possiede tre tastiere di 61 note ciascuna ed una pedaliera concavo-radiale di 32.
Adatto per qualsiasi tipo di repertorio, si presta particolarmente al repertorio romantico, grazie alla sonorità pastosa e ai timbri orchestrali.